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适合大数据的聚类算法Mini Batch K-Means

Author
宋天龙
发布于 2017-07-09
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适合大数据的聚类算法Mini Batch K-Means
AI 智能核心导读

Mini Batch K-Means是专为大数据量场景优化的聚类算法。它通过分批处理抽样机制,有效解决了传统K-Means算法在海量样本下耗时过长的性能瓶颈。该算法在大幅缩减计算时间的同时,仍能保持极高的聚类准确度,实现了效率与精度的完美平衡。借助Python的sklearn库即可快速实现,是处理大规模数据聚类任务的高效方案。

深入理解 Mini Batch K-Means:大数据量下的高效聚类算法

[K-Means 算法] 是常用的聚类算法,但其算法本身存在一定的问题,例如在大数据量下的计算时间过长就是一个重要问题。为此,Mini Batch K-Means,这个基于 K-Means 的变种聚类算法应运而生。

大数据量是什么量级?通常当样本量大于 1 万做聚类时,就需要考虑选用 Mini Batch K-Means 算法。但是,在选择算法时,除了算法效率(运行时间)外,算法运行的准确度也是选择算法的重要因素。那么,Mini Batch K-Means 算法的准确度如何?

准确度与效率的完美平衡

minibatchkmeans11
minibatchkmeans11

上图是我们对 3 万的样本点分别使用 K-Means 和 Mini Batch K-Means 进行聚类的结果。由结果可知,在 3 万样本点的基础上,二者的运行时间相差 2 倍多,但聚类结果差异却很小(右侧粉红色的错误点)。

因此,Mini Batch K-Means 是一种能尽量保持聚类准确性,同时大幅度降低计算时间的聚类模型。

K-Means 的性能瓶颈:计算时间与样本量的关系

K-Means 的计算时间到底跟样本量之间是怎样的关系?(用脚想也知道是样本量越大,计算时间越长),我们用一个实例来实验下。

在下面的例子中,利用 Python 生成一个具有三个分类类别的样本类,其中的样本点(二维空间)的数量从 100 开始增长到 1,000,000(步长为 1000),我们用图例来看看计算时间与样本量的关系。(为了得到下面这幅图,我等了 2 个小时)结果如下:

time_minibatchkmeans11
time_minibatchkmeans11

从图中可以发现,在样本点为二维空间前提下:

  • 当数据量在 2 之下时,计算时间都可以接受(2 秒以内);
  • 但是计算时间跟数据量基本成线性关系,计算 1,000,000 个样本聚类耗时近 16 秒。

由此可以试想,如果你的观测点有更多维度(更多维度意味着需要更多的计算量),那么耗时将比上述场景大很多。

核心原理:什么是 Mini Batch?

回到本文的主体算法 Mini Batch K-Means 上来,应用 Mini Batch K-Means 能尽量在保持数据准确性的前提下降低运算时间,它是怎么做到的?

Mini Batch K-Means 使用了一种叫做 Mini Batch(分批处理) 的方法对数据点之间的距离进行计算。

  • 核心优势:计算过程中不必使用所有的数据样本,而是从不同类别的样本中抽取一部分样本来代表各自类型进行计算。由于计算样本量少,所以会相应地减少运行时间。
  • 必然代价:抽样也必然会带来准确度的下降。

实际上,这种思路不仅应用于 K-Means 聚类,还广泛应用于梯度下降、深度网络等机器学习和深度学习算法。

Python 代码实现

Mini Batch K-Means 的使用方法非常简单,跟 K-Means 一样,在 Python 的机器学习库 SKlearn 中,通过 fit 方法训练数据,然后通过 labels_ 属性获得每个样本点的聚类结果值。

演示代码如下:

python
1import numpy as np 2from sklearn.cluster import MiniBatchKMeans 3from sklearn import datasets 4 5iris = datasets.load_iris() 6X = iris.data 7clf = MiniBatchKMeans(n_clusters=3) 8clf.fit(X) 9pre_clu = clf.labels_ 10 11# 将原始数据集 X 和聚类结果标签组合成新数据集并输出前 10 条 12new_X = np.column_stack((X, pre_clu)) 13print(new_X[:10])

运行结果如下:

code
1array([[ 5.1, 3.5, 1.4, 0.2, 1. ], 2 [ 4.9, 3. , 1.4, 0.2, 1. ], 3 [ 4.7, 3.2, 1.3, 0.2, 1. ], 4 [ 4.6, 3.1, 1.5, 0.2, 1. ], 5 [ 5. , 3.6, 1.4, 0.2, 1. ], 6 [ 5.4, 3.9, 1.7, 0.4, 1. ], 7 [ 4.6, 3.4, 1.4, 0.3, 1. ], 8 [ 5. , 3.4, 1.5, 0.2, 1. ], 9 [ 4.4, 2.9, 1.4, 0.2, 1. ], 10 [ 4.9, 3.1, 1.5, 0.1, 1. ]])

应用场景与参数配置

由于 Mini Batch K-Means 跟 K-Means 是极其相似的两种聚类算法,因此应用场景基本一致,具体请参考 [K均值(K-Means)]。

其中,Mini Batch K-Means 可配置的参数如下:

python
1class sklearn.cluster.MiniBatchKMeans(n_clusters=8, init='k-means++', max_iter=100, batch_size=100, verbose=0, compute_labels=True, random_state=None, tol=0.0, max_no_improvement=10, init_size=None, n_init=3, reassignment_ratio=0.01)

补充说明(尾巴)

  • 默认聚类数量:默认情况下,无论是 K-Means 还是 Mini Batch K-Means 都是需要指定聚类数量,即算法里面的 n_clusters 参数值,但实际应用时发现不指定也是可以的。这并不意味着 Python 会“自动”帮你选择最佳类别数,而是已经预置了一个默认的类别 8。如果你不去设置,它会默认分为 8 个类别。
  • Mini Batch 的定义与大小:既然是通过 Mini Batch 进行抽样,那到底 Mini Batch 是什么?Mini Batch 是原始数据集中的子集,这个子集是在每次训练迭代时抽取的样本。这个值默认是 100 个,可以通过 batch_size 参数进行设置。
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最后修订: 2017-07-09